北美海棠苗水分管理除了要依据树体生长发育的不同时期确定外，还要考虑降水量和土壤干旱程度。海棠苗的不同生长发育时期，对水的需要量也不同，如果在发育的需水髙峰期而降水量又少的情况下，要通过灌水来加以补充。当土壤含水童低于田间持水量的60%时，就需要灌水。灌水量主要依据土壤含水量而定，并没有固定的数值，每次灌水后以土壤含水量达到田间最大持水量的80%左右为宜。灌水方法以沟灌、喷灌、滴灌、渗灌为好。

降雨过多的地区或涝洼地，常常会造成积水，影响。北美海棠苗根系的呼吸，降低根系活力，使果树的生长发育受到不利影响。因此，对于积水的苗圃基地，要注意及时排水。通常在苗圃基地边缘或果树行间开设排水沟，将果园的积水及时排出。